משרד האוצר הגיב בחריפות להאשמות משטרת ישראל בנוגע להקפאת תקציב מבנה הימ"מ, וטען כי התקציב כבר הועבר אך המשטרה בחרה שלא לקדם את הפרויקט. לדברי האוצר, ההחלטה התקבלה על ידי המפכ"ל שהעדיף לתעדף נושאים אחרים. האוצר הוסיף כי "הניסיון להציג מצג שווא הפוך, תוך ניצול ציני של לוחמי הימ"מ, הוא מצער ומיותר". מוקדם יותר פרסמה המשטרה הודעה בה האשימה את האוצר בהקפאה חד צדדית של תקציב המבנה המיועד ליחידה הלאומית למלחמה בטרור, וטענה כי מדובר ב"פגיעה ממשית ומיידית בביטחון מדינת ישראל ובאזרחיה". הבר לביטחון לאומי איתמר בן גביר כתב בחשבון הטוויטר שלו: "סמוטריץ', תוריד את הידיים מהשוטרים".