לצד הטיפול הרפואי שיקבלו החטופים שישובו בעסקה, במערכת הבריאות נערכים גם לטיפול בתסמונת נדירה בשם "סינדרום שטוקהולם", תופעה בה הקורבן מפתח רגשות חיוביים כלפי שוביו, לעתים עד כדי הזדהות עמם. הצוותים הרפואיים ערכו תרגולים וסימולציות בשבועות האחרונים גם למקרה נדיר שכזה.
מערכת הבריאות נערכת להתמודד עם אתגר זה על ידי הקמת צוותים רב-תחומיים בבתי החולים, הכוללים פסיכיאטרים, פסיכולוגים, עובדים סוציאליים ורופאים, שיתמכו בחטופים לאורך כל שלבי השיקום. במקביל, נעשה שימוש במרכזי תמיכה חיצוניים בקהילה, בהם יוכלו החטופים להמשיך לקבל ליווי מקצועי ולבנות מחדש את חייהם.
